Описание биоразнообразия
Флора заповедника содержит 711 видов сосудистых растений; из них 9 видов растений занесены в Красную книгу России; 39 видов – в Красную Книгу Камчатки; 4 вида растений на текущий момент произрастают только на территории заповедника и неизвестны для других районов полуострова.
Облик ландшафтов заповедника определяют широко распространенные виды (береза Эрмана, кедровый и ольховый стланики, вейник Лангсдорфа, лабазник камчатский). Типологическое разнообразие сообществ высокое: выделено 43 основных формации, относящихся к 7 типам растительности (лесному, стланиковому, кустарниковому, луговому, тундровому и двум типам болотной растительности.
В целом, флора заповедника как составная часть флоры полуострова Камчатка представлена таежно-лесной, бореальной флорой, обогащенной арктоальпийскими видами.
Для территории заповедника характерны леса из лиственницы Каяндера, редкостойные леса из березы Эрмана и заросли кедрового и ольхового стланика. Для многих видов (черемуха азиатская, любка Хариса, бузина камчатская, боярышник зеленомякотный) территория заповедника служит северо-восточной границей ареалов.
Видовой состав фауны заповедника, в некотором роде обеднен, из-за полуостровного положения территории. В целом, на полуострове отсутствуют виды насекомых, которые связанны в своем развитии с хвойными лесами; отсутствуют виды млекопитающих таежной зоны; среди птиц примечательно отсутствие типично лесных видов; не обитают здесь и настоящие пресноводные рыбы.
Что касается териофауны, то территорию заповедника населяет типично полуостровная, несколько обедненная фауна млекопитающих. Длительная изоляция полуострова привела к образованию среди млекопитающих некоторых эндемичных форм.
Для орнитофауны заповедника и полуострова, в целом, характерно наличие относительно многочисленных видов (до 45-60% видового состава), обитающих на водоемах и их побережьях. Это представители отрядов Пластинчатоклювых и Ржанкообразных (чайки, чистики и кулики). Водно-болотные угодья заповедника имеют большое значение для гнездования гусеобразных птиц (до 3,5 тыс. пар 20 видов), отдыха в периоды миграций и на зимовке. Комплекс лесных видов (27-40%) наземной орнитофауны Камчатки также обеднен и относится к таежному типу фауны, распространенной в Восточной Сибири.
На территории Кроноцкого заповедника в настоящее время зарегистрировано обитание 32 видов птиц, занесенных в Красную Книгу России, Дальнего Востока и Камчатки.
Ихтиофауна пресных водоемов заповедника представлена почти исключительно проходными и полупроходными видами лососей. В настоящее время во внутренних водоемах и в охраняемой морской акватории заповедника достоверно зарегистрированно 103 вида рыб. Наибольшее значение в природных комплексах и экосистемах заповедника представляют популяции лососевых рыб. Большинство рек заповедника являются местом нереста 5 видов тихоокеанских лососей. Наиболее крупные нерестилища расположены в бассейнах рек Кроноцкая, Богачевка, Большая и Малая Чажма.
Характеризуя фауну заповедной территории, следует отметить, что она наиболее полно представлена видами всех систематических групп региона, что делает ее наиболее ценной в плане устойчивого сохранения биологического разнообразия полуострова Камчатка.