Первый и единственный в Республике Башкортостан национальный парк «Башкирия» был создан Постановлением Совета Министров РСФСР № 398 от 11 сентября 1986 года. ГПНП «Башкирия» был создан для сохранения уникального природного комплекса горных лесов Южного Урала и особо ценных участков: геологического комплекса с многочисленными пещерами, карстовыми воронками – Кутук - Сумганского урочища, карстового моста Куперля, созданного ручьем с одноименным названием, урочища Муйнак-таш со скалой останцем. Интересным и притягательным объектом для отдыха является Нугушское водохранилище, включенное в состав национального парка без изъятия из хозяйственной деятельности. Постановлением правительства Российской Федерации от 9 октября 1995 года № 990 «Об изменении решений Правительства Российской Федерации в связи с принятием Федерального закона «Об особо охраняемых природных территориях» ГПНП «Башкирия» переименован в национальный парк «Башкирия». Он является государственным учреждением и относится к особо охраняемым природным территориям федерального значения. В своей деятельности национальный парк руководствуется Федеральным законом «Об особо охраняемых природных территориях» и Положением, утвержденным Министерством природных ресурсов Российской Федерации. Однако история организации национального парка «Башкирия» началась не в 1986 году, а намного раньше. Часть территории национального парка «Башкирия» в восточной части Мелеузовского района в долине реки Нугуш, включая Нугушское водохранилище, около 20 километров к западу от Прибельского филиала Башкирского государственного заповедника, охранялась 19 лет, будучи территорией Мелеузовского государственного заказника. Постановлением Совета Министров Башкирской АССР от 25 июля 1967 года № 401 «О создании Архангельского, Бирского и Мелеузовского заказников» в целях усиления охраны ценных пушных, копытных зверей и птиц и создания благоприятных условий для их размножения и распространения основаны Архангельский видовой заказник по водоплавающей и болотной дичи на площади 1 819 га, Бирский комплексный госзаказник на площади 18 100 га и Мелеузовский комплексный госзаказник на площади 12 800 га. В апреле 1978 года распоряжением Совета Министров БАССР № 456 срок действия заказника был продлен до 1990 года, но в сентябре 1986 года его территория была включена в созданный государственный природный национальный парк «Башкирия».